由于食品種類繁多，原料來源廣泛，食品工業廢水具有懸浮物、油脂含量高，重金屬離子多，COD和BOD數值大，誰知和水量變化幅度大，氮、磷化合物含量高，某些情況下水溫也較高等特點。污水處理工藝分成一級處理、二級處理和三級處理。對于食品工業污水，一級處理一般是采用固液分離技術去除污水中的懸浮物和漂浮物；二級處理是主要處理過程，一般采用生物處理技術去除水中有機物等有毒物質，一般采用膜處理法、強氧化劑等技術將污水進一步進化。

食品加工廢水中較大懸浮物和油脂可以采用懸浮分離技術去除，以SS值表示的水中懸浮物（包括膠體）可以采用固液分離技術去除；污水中以COD、BOD等表示的有害物質可以采用生物處理技術去除；處理后的水要經過消毒處理才能排放，生物處理過程中產生的污泥要進行脫水排放。
綜上所述，食品加工廢水處理的典型工藝流程圖如下：
       污水→懸浮分離→調節池→生物處理→沉淀（過濾）→消毒→達標排放放 ↓  污泥處理