醫院污水，尤其是傳染病醫院、結核病醫院污水中，不同程度地含有多種病菌、病毒、寄生蟲卵和一些有毒有害物質。這些病菌、病毒和寄生蟲卵在環境中具有一定的抵抗力，有的在污水中存活時間較長，當人們食用或接觸被病菌、病毒、寄生蟲卵和有毒有害物質污染的水或蔬菜時，就會使人致病或引起傳染病的暴發流行。

目前比較常用的醫療污水處理工藝：一級處理工藝、二級處理工藝、傳統活性污泥法、吸附再生法、SBR 法、AB 法、A/O和A2/O法A/O系統和A2/O系統是由缺氧-好氧或厭氧-缺氧-好氧、CASS工藝生化處理等諸多方法。出水通過與水泵聯動或與虹吸水加入消毒劑混合后，進入接觸池，在接觸池內污水和消毒劑 經過一定時間的接觸后達到水質凈化和消毒要求之后排放。